Stereo-seq新品一覽
· 載體版時空芯片:提升操作便捷性 · 時空一體機:時空智能一站式平臺,通量可達 24 張芯片/天 · Stereo-seq 空間單細胞分析:實現圖像質控、拼接、配準、細胞分割全自動化 · Stereo-seq TCR/BCR 富集:適用于腫瘤微環境、器官移植、免疫治療等領域 · Stereo-seq H&E+轉錄組:實現同張切片獲得組織形態學和轉錄組學信息 · Stereo-seq mIF+轉錄組:通過熒光抗體染色,實現同張切片的蛋白和轉錄組共檢測 · Stereo-seq 空間多蛋白:在同張切片上實現全轉錄組和多達十余種蛋白標記物同時檢測 即日起,所有科研工作者可通過掃描下方二維碼,提交信息申請免費體驗。 # 華大時空正式推出新品體驗計劃# 「工欲善其事,必先利其器」,華大作為時空組學領域的重要推動者,一直致力于為生命科學領域提供通用且功能強大的工具,助力更多的科學新發現。10 月 29 日,在 ICG- 17 時空組學與疾病的會場上,深圳華大生命科學研究院時空工具主任科學家廖莎,正式推出載體版時空芯片、時空一體機、空間單細胞分析、空間 TCR/BCR 富集、H&E+轉錄組、mIF+轉錄組、空間多蛋白等新品體驗計劃。 # Stereo-seq技術最新進展和體驗計劃 # 華大自主研發的 Stereo-seq 實現了500 nm 的分辨率(單個細胞可被 400 個像素點捕獲),同時捕獲面積可達 13 cm×13 cm,成為全球領先的能同時實現「納米級分辨率」和「厘米級全景視場」的技術,且實現了基因與影像同時分析。該技術作為新時代的分子「顯微鏡」,將推動繼顯微鏡和 DNA 測序技術以來的生命科學領域第三次科技革命。 Stereo-seq 已經應用于發育、疾病、再生等領域,因領先的技術優勢,不到半年的時間,相關科研成果已陸續在Cell、Nature和Science三大頂級學術期刊發表,實現 CNS 大滿貫,其中有兩篇刊登為當期封面。這個核心工具的突破,讓研究者得以用全新的視角觀察生命,成為高水平文章發表的基石。 本次大會上,廖莎從通用性和引領性兩方面重磅發布了 Stereo-seq 的技術突破和新品體驗計劃。 通用性 在通用性方面,華大時空從樣本和操作性出發,提升 Stereo-seq 技術的可及性。 樣本可及性 在樣本可及性上,Stereo-seq 實現了將在液氮或 - 80℃ 環境中保存的組織進行組織切片,解決特定場景下樣本得不到及時包埋的困擾。時空組學的技術特點是原位捕獲,而有冰晶的樣本往往阻礙研究人員獲取組織內細胞的原位信息,對此,Stereo-seq更新了包埋方案,緩解了樣本的冰晶問題。 另外,某些含水量較高或空腔較多的組織,容易出現脫片或 RNA 擴散問題。針對這類組織,Stereo-seq 優化并兼容了多聚甲醛樣本處理方案,可以有效解決 RNA 的擴散,保證組織原位信息的獲取。 實驗便捷性 研發人員開發了載體版時空芯片方案,降低了操作復雜性,提高流程的流暢性,使 Stereo-seq 技術操作更簡單,同時減少樣本操作間的差異。 操作智能化 本次發布會上重磅亮相的時空一體機,可提供從樣本到數據的全自動化智能解決方案。在組織拍照后,可實現芯片 cDNA 文庫的全自動化,且最高通量可達 24 張切片/天,大大縮短手工操作時間,減少人為操作導致的批次效應,逐步實現 Stereo-seq 技術的標準化。 引領性 空間單細胞分析 在空間單細胞方面,Stereo-seq 通過芯片試劑全面更新實現捕獲性能提升;同時,通過華大自主研發的 Workflow,實現圖像質控、拼接、配準、細胞分割全自動化,實現了真正的自動化空間單細胞分析。 空間 TCR/BCR 富集 為加速時空組學技術在臨床方向的應用,Stereo-seq 開發了空間免疫組庫測序技術,目前針對 TCR/BCR 的 V 區設計了 40 多對引物,以 cDNA 為模板,富集 TCR/BCR 相關基因。一個典型的例子,癌癥病人的扁桃體樣本經過富集后,被檢測到的 TCR/BCR 基因有了百倍至千倍的提升;經過 VDJ 組裝后,在切片上獲得了近 5 萬種 T 細胞克隆型。 H&E+轉錄組 H&E 染色是組織學、病理學常用的技術,目前 Stereo-seq 可以在同一張切片上成功兼容 H&E 染色和轉錄組的分析,更準確地判斷組織分型及獲取特定組織區域的基因表達信息。在算法分析上,Stereo-seq 實現 H&E 圖像與轉錄組表達矩陣的自動配準,科研工作者可以根據 H&E 染色的信息圈選感興趣的區域,提取對應的表達矩陣,利用華大時空高級分析軟件進行下游的高級分析,包括細胞聚類、注釋、差異分析、通路富集分析等。 mIF+轉錄組 多重免疫熒光(mIF+轉錄組)可實現同張切片的多蛋白標記物和轉錄組共檢測和共定位,同時輔助轉錄組實現細胞類型精準注釋及細胞生物學功能解析。單細胞分辨率下,通過蛋白染色實現細胞重要結構的鑒定。 空間多蛋白 在同一張切片上,實現全轉錄組和多達十余種蛋白標記物的同時檢測,獲得更準確的細胞注釋及鑒定。目前 Stereo-seq 技術分辨率為 0.5 μm,遠高于同類技術的最高分辨率,實現更加精細的空間蛋白和轉錄組的聯合分析。
以上重磅新品,將于 2023 年陸續面市。為了讓用戶更好地體驗 Stereo-seq,廖莎同時發布了新品體驗計劃,即日起,所有的科研工作者都可通過提交信息申請免費體驗。 掃碼報名 免費體驗
未來,時空組學將朝著智慧實驗室、多樣本多組學、便捷與開放的平臺方向,打造全方位的時空生態系統,降低科學發現的門檻,賦能更多領域的科學研究。 聯系我們 對時空組學或單細胞組學整體解決方案感興趣的老師,可選擇以下方式和我們聯系,我們將及時為您進行詳細的介紹: 1. 發送信息至郵箱:collaboration@stomics.tech; 2. 掃描上方二維碼報名,申請免費體驗。 |
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